Bioinformatikai adatelemzési keretrendszer fejlesztése griden

OData támogatás
Konzulens:
Dr. Hullám Gábor István
Méréstechnika és Információs Rendszerek Tanszék

A kutatásokat végző bioinformatikusok és biológusok hatalmas mennyiségű adatokon végeznek analíziseket. Ezeknek az elemzéseknek a végrehajtása különböző statisztikai eszközök alkalmazásával történik, melyek általában nagyon számításigényesek. Ennek a problémának a kiküszöbölésére egy megoldás egy grid alapú elosztott számítási környezet létrehozása, ami tartalmazza az elemzéseket végző alkalmazásokat futtató keretrendszert. Ehhez a Condor rendszert nyújt segítséget, amit pontosan az ilyen nagy számítási igényű feladatok megoldására hozták létre.

A feladat célja az volt, hogy létrehozzak egy ilyen rendszert, mely képes a genomikai mérések eredményeinek kiértékelésére az MDR (multifactor dimensionality reduction) algoritmust felhasználva. Ez a program egy már létező web alapú Java EE-s rendszer részeként került implementálásra. Az irodalomkutatást és tervezést követően létrehoztam az új komponenseket a rendszerben, valamint egy új alkalmazást írtam, ami a Condor rendszeren való futtatást végzi.

Letölthető fájlok

A témához tartozó fájlokat csak bejelentkezett felhasználók tölthetik le.